Systemy ochrony przed szkodnikami polega na systematycznym sprawdzaniu wszystkich miejsc, w których mogły zagnieździć się szkodniki: przede wszystkim gryzonie a także robaki. Jeżeli już jest bardzo dobrze zorganizowany, daje możliwość bardzo szybko wykryć co i w jakiej ilości pojawiło się na terenie firmy, czy w magazynie. Dobry system ochrony przed szkodnikami zawiera także odpowiednie procedury zwalczania szkodników, które są przygotowane jeszcze przed tym, nim się pojawią i dostosowane do zakładu, którego dotyczą.

Monitoring szkodników warto powierzyć profesjonalnej firmie, która wie jak eliminować zagrożenie z ich strony. Jeśli firma zajmuje się nim własną pracą, bywa różnie z jego realizacją. W wielu firmach problem polega na tym, że zbudowane są wszystkie procedury: jak monitorować miejsca strategiczne, jak je zabezpieczać i sprawdzać, czy insekty lub gryzonie się pojawiły. Te procedury obowiązują jednak tylko na papierze, bo w praktyce nikt (albo większość) ich nie przestrzega. Jeśli para się tym zewnętrzny podmiot, który w sytuacji niewywiązania się z umowy nie otrzyma wynagrodzenia, zaangażuje się w swoje zadanie do końca. Profesjonalne firmy nie tylko sumiennie podejdą do samego monitoringu, ale będą też działać sprawniej jeśli chodzi o samo zwalczanie szkodników. Kiedy na terenie magazynu pojawią się owady, konieczna jest dezynsekcja. Tę można przeprowadzić na kilka sposób. Wybór odpowiedniego zależy od tego, czy magazyn jest pusty, czy pełny i co w nim się znajduje. Dezynsekcję można wykonaćprzy użyciu takich środków, jak para (czyli gorące powietrze) promieniowanie ultrafioletowe, gaz, lasery). Szkodniki można też usuwać mechanicznie, czyli dosłownie je wyłapywać do specjalnych pułapek. Dostępne są jeszcze środki biologiczne (użycie innych owadów wyżej położonych w łańcuchu pokarmowym) lub chemiczne (tylko w pustych magazynach, które można późniejszy czas swobodnie przewietrzyć). Wszyscy są zgodni co do tego, że lepiej zabezpieczyć magazyn, czy silos przed owadami, niż w przyszłości z nimi walczyć.

Zobacz więcej: systemy ochrony przed szkodnikami.